- Cánh cửa thần kì chỉ cho phép đi trong một giới hạn không gian nhất định là 10 năm ánh sáng. Nếu quá, bảo bối này sẽ trở nên vô hiệu.
- Cần phải xác định đúng vị trí vì nếu lơ đãng suy nghĩ sai vị trí, bảo bối lập tức sẽ dẫn họ đến một nơi dị thường chưa ai từng đặt chân đến.
- Phải kiểm tra trước tình trạng nơi đến nếu mà hấp tấp thì cánh cửa sẽ dẫn ra vũ trụ rất nguy hiểm vì trong môi trường vũ trụ không có không khí.
- Khi bị hỏng, cánh cửa thần kì sẽ đưa người dùng tới những địa điểm không mong muốn hoặc sẽ bị kẹt, gần như không thể mở ra (trừ khi có một lỗ thủng trên cánh cửa)
- Một hạn chế khác của cánh cửa là nó chỉ có thể kết nối hai địa điểm một cách an toàn nếu chúng đều được xác định trong bản đồ của máy tính.